党中央提出乡村振兴战略以来，将绿色理念融入到农业的发展，成为乡村振兴的内在要求。近年来，生态文明建设与乡村振兴战略双线推进，生态学研究与农业经济协同合作，适应乡村全面振兴的生态农业正在形成“绿水青山就是金山银山”的产业效应。
生态农业的生产方式最初是基于人们对生态环境危机的反思而提出的。中国社会科学院农村发展研究所农村环境与生态经济研究室主任于法稳介绍说，人们逐渐认识到长期以来农业生产中毁林毁草开垦、围湖造田、森林滥伐、草场滥牧、渔场滥捕和工业污染等行为所累积的越来越严重的生态经济问题，并开始了解决这些问题的路径探讨。正是在此背景下，学界有志之士基于中国农业生产中面临的生态环境问题，提出了生态农业理论、生态农业工程理论等，并将其付诸于生态农业的实践活动。
中国科学院植物研究所蒋高明是国内较早提出并探索将生态学理论运用于农业生产方式改革的学者。他认为，传统现代农业严重依赖石油化工的现代农业是不可持续的，而建立在生态循环原理基础上的生态农业具有抵抗各种风险的强大能力。“经历一个多世纪的发展，生态学日益成熟，一些基本原理应用到农业越来越发挥重要的作用，比如生态系统原理、生态位原理、生物多样性原理等。”他表示，生态农业是在传统农业智慧基础上，利用现代生态学原理和技术提升的一类环境友好型农业模式。
作为全国人大代表，山东社会科学院经济研究所研究员张卫国多年来关注农村经济的发展，结合在农村的调研，他认为，根据国内外相关理论与实践，生态农业是指遵循自然规律，按照生态学原理和经济学原理，综合运用现代科学技术成果、现代管理手段、传统农业有效经验建立起来，能同时获得高水平农业经济效益、生态效益和社会效益的高效生态产业。
在于法稳看来，生态农业的核心内涵，就是协调经济发展与环境保护之间、资源利用与保护之间的矛盾，实现经济、生态、社会协调发展。具体而言，生态农业以生态学原理和生态经济规律作为理论依据，注重各种要素的空间差异性，讲求并真正地实施因地制宜原则，选择适宜的生态农业发展模式。
乡村全面振兴需要加强农村生态文明建设，保持战略定力。发展生态农业，有助于彰显生态文明建设与乡村振兴战略的叠加效应。
助推农村生态文明建设和乡村全面振兴，可以利用生态农业的优势。蒋高明认为，生态农业具有十分明显的生态、社会与经济效益。保护生态环境，告别面源污染，减少化肥使用，增加耕地有机质，全面提高水分与养分利用效率，节约资源；产出的食物质量高，产量高，生态农业单位土地经济效益高；种养结合、种植多样化、间作套种、立体种植，实现物种多样性丰富，提高系统稳定性和抗风险能力；发展生态农业可全面带动农民就业，形成新的经济增长点。
“农村生态文明建设是我国生态文明建设的重要组成部分，而生态农业是农村生态文明建设的重要内容。”在于法稳看来，生态农业的发展有助于全面贯彻落实绿色发展理念，并助力乡村振兴战略的实施，也有助于实施健康中国战略，提升农产品的国际市场竞争力。
“发展生态农业不仅是绿色发展的必然选择，乡村振兴的战略抉择，也为新型城镇化打开突破口。”张卫国提出，通过农业生态循环产业发展，拉长有机农业链条，生态农业与二、三产业的融合发展等具体途径，有效保护生态环境，节约利用土地、集约开发利用自然资源，形成范围经济、规模经济、聚集经济等溢出经济效果明显的企业生态群落和产业集群。
人民日益增长的安全优质农产品需求与其供应不足之间的矛盾，是新时代我国社会主要矛盾在农业领域的突出表现。于法稳认为，发展生态农业，推进农业高质量发展，提高以粮食为主的安全优质农产品的供应能力，是破解社会主要矛盾的一个重要方面。
近年来，全国多地结合地方特点，在生态农业方面进行了卓有成效的探索。如中国科学院的科学家在山东平邑县卞桥镇蒋家庄进行了连续 14 年的长期实验，发展高效生态农业模式。“通过循环的生态模式最大限度地利用了每种产品的副产物，不仅减少了环境污染，改善土壤，还增加了土壤生物多样性，提高了作物产量。利用‘物理+生物’方法取代杀虫剂，以‘人工+机械’除草取代除草剂，或采取‘以草治草’策略。所生产的优质安全产品，通过互联网进行线上销售，增加经济效益，平均每公顷效益是普通农田的3-5倍。”蒋高明介绍说，
黑龙江省汤原县发展农业循环经济单元，探索了新模式。“养殖300头肉牛，匹配70公顷土地，形成了种养结合农牧循环单元。”于法稳认为，恢复种植业与养殖业之间的内在生态联系，以种植业的发展来消纳养殖业的废弃物，由后者来提供有机肥，减少化肥施用量。这是打赢农业面源污染攻坚战的有效途径与措施，更是提高农产品质量，实现农业高质量发展的选择。
受访学者也对未来生态农业的发展提出建议，张卫国建议，应追踪世界生态农业发展前沿，制定生态农业发展的国际合作规划；加强发展生态农业推动乡村振兴的高层研究、战略规划和方案设计；制定符合国情的生态农业发展标准、发展生态农业推动乡村振兴的标准，包括生态农业门类、体系和可以区分的次生产业种类标准，生态农业价值核算标准，发展生态农业推动乡村振兴的目标框架、核算框架、组织框架等；此外也需要加大公共投入，典型示范引领，总结不同典型的成功经验，揭示共同的发展规律或趋势。
于法稳建议，生态农业的发展应时刻把保障国家粮食安全放在首位，将确保农产品质量安全放在重要位置，进一步强化水土资源质量的核心地位，还需要制定质量标准化体系，充分发挥中医药的系统优势。生态农业是一个复杂的系统工程，需要学界超越生物学、生态学、社会科学和经济学之间的界限，需要多学科专家的共同参与，实现多学科的交叉与综合，提供理论支撑。